Determinar si existen diferencias de expresión entre los miRNA de tejido sano y tumoral de adenocarcinoma de pulmón y carcinoma epidermoide de pulmón, con lo que podrían ser usados como biomarcadores.
Se ha extraído y secuenciado el miRNA de tejido tumoral y sano adyacente de muestras de adenocarcinoma y carcinoma epidermoide de dieciséis pacientes intervenidos en el Hospital Regional de Málaga. Esas secuencias se han analizado con un flujo de trabajo bioinformático específico que conlleva varios pasos: 1º) preprocesar las lecturas, 2º) mapearlas sobre el genoma humano de referencia, 3º) determinar la expresión de los miRNA en cada una de las muestras, 4º) calcular su expresión diferencial entre el tejido sano y el tumoral de cada paciente, 5º) realizar un análisis
funcional de los miRNA encontrados.
Hemos analizado los miRNA con expresión diferencial en cada uno de los tipos histológicos estudiados. El análisis del adenocarcinoma y carcinoma epidermoide de pulmón ha dado como resultado un total de 82 y 360 miRNA diferencialmente expresados (miDE), respectivamente. Hemos encontrado 50 miRNA comunes a los dos tipos histológicos, y su análisis funcional indica que están implicados en el crecimiento, desarrollo y movimiento celular, que se produce tanto en la célula normal como en el cáncer.
Los miDE encontrados son una fuente de biomarcadores, al tener una reprogramación específica en cáncer, y ser obtenibles de forma no invasiva.
Ultrasecuenciación, RNA-seq, miRNA, cáncer de pulmón, carcinoma epidermoide de pulmón, adenocarcinoma de pulmón.
Acceso Área Privada
